1993 m. Švėkšnos vidurinės mokyklos muziejus tapo Šilutės muziejaus filialu ir įkurtas viename iš Švėkšnos dvaro pastatų, buvusių Švėkšnos parko teritorijoje, netoli katalikų bažnyčios ir „Genovaitės“ vilos. Nuo 2005 m. muziejus veikia naujose patalpose Švėkšnos „Saulės“ gimnazijos pastate. Nemažai šio muziejaus eksponatų priklausė Švėkšnos dvarui. Gausus senosios raštijos palikimas, vienas vertingiausių leidinių – XVII a. Lietuvos Statutas.
Muziejuje nuolatiniu pagrindu veikia keturios skirtingos ekspozicijų salės: etnografijos, archeologijos, dvaro bei miestelio istorijos. Ekspozicijos, parodos keičiamos pagal poreikį.